各大政治派系为了争夺北方水师副都督之职，文武百官各自旁征博引，竭尽全力为自己所支持的人选站台；经过一番唇枪舌剑、激烈争论、优胜劣汰，最后只剩下南方士族和河东士族举荐的裴仁基、关陇贵族和关中士族所举荐和支持的王仁恭。
在举荐和支持裴仁基的过程中，裴矩为首的河东士族出于「举才不举亲」的官场禁忌，处于助攻的地位；主攻的，是与其达成合作关系的南方士族。然而哪怕两者合力，也在关陇贵族和关中士族步步紧逼之下，落了下风。
这是因为关陇贵族和关陇贵族所支持的王仁恭的能力、资历、功绩都不弱于裴仁基，很多方面的优势，甚至远超裴仁基。
王仁恭是天水上邽人，他当过秦孝王杨俊记室、长道令、在平陈之战中，随杨俊驻扎在夏口，与时为陈朝将领的周罗睺、周法尚等人边打边谈，促使周罗睺等人相继率军降隋，他也因功拜车骑大将军。后来又随杨素击败突厥于灵武郡，获得了上开府之勋，并以骠骑大将军典蜀王杨秀军事，接着又奉蜀王杨秀之命，多次带兵大破为祸地方的獠人。
他以上这些经历、资历，裴仁基也有，所以两人相比之下，难解难分。但是等到杨广登基为帝，区别就出来了。
杨谅当年发动叛乱之时，王仁恭再次跟随杨素作战，战后因功进位大将军、拜汲郡太守；而裴仁基当时却是杨谅属官，他固然因为反对杨谅造反被打入太原大牢，事后得到杨褒奖，然而与立下大功的王仁恭根本没有可比性。
这也是关陇贵族和关中士族能够压着南方士族、河东士族的主要之处。
不过裴仁基也有自己的优势，那就是他担任过水师的中级将领，并且多次率领大隋水师中的某支舰队在南方的江河湖海里平叛，最后他每次都获得了大胜。而王仁恭虽然也在汉口与陈朝水师打过仗，可他仅仅只是一个「舰长」，之后的战功、封赏都是在陆上作战所获。
在实战的差距之上，关陇贵族和关中士族所持的主张是北方水师不是立刻作战，王仁恭可以学，当北方水师拥有了战斗力之后，他早己蜕变成一名合格的副都督了；他们这个论调比较牵强，只不过他们却话音一转，再以南方水师腐败的现状对裴仁基加以攻讦，认为他能力虽然胜任，可品德、忠诚、操守不行，否则的话，他为什么没有把腐败之事，向圣人透露？
当然，他们也承认腐败与裴仁基无关，可他作为中层将领，不可能不知道水师存在的问题，然而他却不举报，这就证明他不称职。
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